《坏蛋联盟：闯关大行动》是同名电影的前传，故事中“坏蛋联盟”依然是坏蛋——只是他们还没学会怎么当坏蛋。为了赢得梦寐以求的恶名昭彰，他们必须学会通力合作，努力成为最棒的“最差劲”罪犯。这意味着他们要策划大胆的抢劫案，与其他动物犯罪团伙一较高下，还要应对最棘手的挑战：成为室友。